当负责保护身体免受疾病侵害的免疫系统与健康细胞作斗争时，就会出现自身免疫疾病。在这里，免疫系统无法区分健康组织和抗原，结果身体引发了破坏正常组织的反应。一些未知的触发因素碰巧迷惑了免疫系统，而不是对抗感染，而是破坏了身体自身的组织。
经常受自身免疫性疾病影响的部位包括血管、结缔组织、内分泌腺、关节、肌肉、红细胞、皮肤。自身免疫性疾病的一些常见症状包括疲劳、发烧、关节疼痛和皮疹。一些常见的自身免疫性疾病包括艾迪生氏病、多发性硬化症、1 型糖尿病、干燥综合征、反应性关节炎、皮肌炎、恶性贫血、乳糜泻。这种疾病可能导致身体组织破坏、器官异常生长、器官功能改变。
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