功能基因组学是分子生物学的一个领域，试图利用基因组和转录组项目（例如基因组测序项目和 RNA-seq）产生的大量数据来描述基因（和蛋白质）功能和相互作用。
功能基因组学研究的目的是在全球（全基因组）规模上了解基因型和表型之间的复杂关系。研究调查了一系列过程，例如转录、翻译和表观遗传调控。
功能基因组学相关期刊
分子生物标志物和诊断、遗传性疾病和遗传报告、纳米医学和生物治疗发现、系统发育学和进化生物学、单细胞生物学、功能基因组学简报、功能基因组学和蛋白质组学简报、比较和功能基因组学、结构和功能基因组学杂志。