许多蛋白质-蛋白质相互作用是由肽识别模块介导的，肽识别模块是与短肽结合的紧凑结构域，在广泛的生物过程中发挥着关键作用。最近的实验蛋白质相互作用数据为我们提供了一个机会来检验我们是否可以解释甚至预测通过计算序列分析它们的相互作用。
蛋白质-肽相互作用的设计具有广泛的实际应用，也揭示了对分子识别基础的洞察。
识别肽的结合配偶体的最简单方法是在亲和力下拉实验中将其用作诱饵，然后直接检测其结合蛋白。Pull-down 测定既可用于确认使用其他技术（例如免疫共沉淀）预测的蛋白质-蛋白质相互作用，也可作为鉴定新型蛋白质-蛋白质相互作用的初始筛选工具。合成肽通常用于通过竞争性破坏结合来验证可疑的蛋白质-蛋白质相互作用。含有特定功能域的生物素化肽及其相应的对照天然肽被固定到亲和素缀合树脂上。样品与树脂一起孵育。然后清洗树脂以去除任何未结合的蛋白质。洗脱结合的蛋白质并使用 SDS-PAGE 进行分析。
蛋白质肽相互作用的相关期刊
生物工程与生物医学科学期刊、蛋白质组学与生物信息学、细胞科学与治疗、细胞与分子生物学、蛋白质工程设计与选择、蛋白质化学进展、氨基酸、肽和蛋白质。