蛋白质组是基因组、细胞、组织或生物体在特定时间表达的整套蛋白质。更具体地说，它是给定类型的细胞或生物体、在给定时间、在限定条件下表达的蛋白质的集合。该术语是蛋白质和基因组的混合。蛋白质组学是对蛋白质组的研究。蛋白质是蛋白质组的一部分。蛋白质组是一组蛋白质序列，可以通过翻译完整测序的基因组的所有蛋白质编码基因而衍生，包括替代产物，例如可能发生这些的物种的剪接变体。
蛋白质组相关期刊
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