MicroRNA测序（miRNA-seq）是RNA-Seq的一种，是利用新一代测序或大规模并行高通量DNA测序对microRNA（也称为miRNA）进行测序。miRNA-seq 与其他形式的 RNA-seq 的不同之处在于，输入材料通常富含小 RNA。miRNA-seq 使研究人员能够检查组织特异性表达模式、疾病关联和 miRNA 亚型，并发现以前未表征的 miRNA。有证据表明失调的 miRNA 在癌症等疾病中发挥作用
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