克拉丽莎·埃里卡
单细胞 RNA 测序数据可以揭示不同细胞类型的分子多样性。最近发表的小鼠脊髓细胞类型图谱尚未合并。在这里，我们使用单细胞转录组数据创建了脊髓细胞类型图谱，将各种数据集合并为一个参考框架。我们提出了出生后细胞类型相互作用的层次框架，其中位置是最高组织级别，其次是神经递质状态、家族和数十个精细群体。我们绘制了成人脊髓中每种神经元细胞的地理分布图，并验证了每种神经元细胞的组合标记代码。我们还展示了几种出生后细胞类型之间复杂的谱系联系。为了帮助标准化细胞类型识别，我们还创建了开源细胞类型分类器 SeqSeek。这项工作提供了对各种类型的脊髓细胞、它们的分子排列及其基因表达谱的综合理解。